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- GWAS 全基因组关联分析有哪些优点和缺点？ - 知乎
引言 全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study, GWAS）是遗传学领域研究复杂性状和疾病遗传基础的强大工具。传统GWAS主要依赖SNP芯片技术，而随着测序技术的飞速发展，全基因组测序（Whole-Genome Sequencing, WGS）逐渐成为GWAS研究的新选择。 WGS-GWAS相比传统GWAS到底有哪些优势呢？
- 全基因组重测序和gwas区别? - 知乎
物种已经做过基因组测序的，再针对该物种的个体进行基因组测序就是重测序。 GWAS 是一种 群体基因组学 分析方法，群体越大结果越趋于准确，简单举个例子，100个肥胖的人，100个体型正常的人，基因组测序后分析，有些位点在肥胖人群中出现的概率显著的高于正常人群的概率，那么就可以说这些
- 在gwas研究中如何寻找最显著的SNP值，然后再根据这个SNP位点筛选候选基因呢？ - 知乎
最显著的SNP指的是P值最小的点，在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点，后来会进一步用conditional 分析去寻找locus上的second signal，或者用stepwise 回归寻找可靠的causal SNP set（也叫做fine-mapping，精细定位）。 但是这些分析一般需要用
- GWAS与WGS的区别？ - 知乎
GWAS与WGS的区别？ WGS好理解就是全基因组的测序，每个碱基都测一下，GWAS就理解不好？ GWAS是不是可以测一个或者多个SNP位点，然后在研究他与疾病的相关性？ 求大神解… 显示全部 关注者 17 被浏览
- 生物信息学全基因组测序GWAS 如何用小样本50甚至更低的样本数寻找与表型相关的SNP位点? - 知乎
个人观点，样本量太少了，50个样本GWAS大概率是找不到什么有效信号的（除非是那些影响特别强烈的主效位点，当然，这种一般早就被研究过了；或者如果你的数据很稀有珍贵当然也可以）。
- 孟德尔随机化—共定位分析—GWAS? - 知乎
在GWAS分析中，一般只针对一个性状进行关联分析，而在QTL分析中，往往可以同时对很多表型进行关联。 此时，我们检验的表型就是每一个基因-开放区域配对数据，因此，我们需要首先确定所有的配对数据，然后为它们分别指定共定位区域。
- 从零开始的孟德尔随机化 - 知乎
一、MR需要什么数据？ GWAS Summary 从上一篇得知，MR是一种利用工具变量来评估暴露与结果之间因果关系的统计方法。而其工具变量一般是选择从GWAS获得的SNPs。 所以，如果我们说获取MR分析的数据集，一般就是指的GWAS数据集。而一般情况下，我们能够从文献和数据库获取的数据都是GWAS Summary，而非
- 请问哪位大神知道如何分析GWAS结果？ - 知乎
请问哪位大神知道如何分析GWAS结果？ 调取出GWAS阈值以上关联的基因，但我想跟自己的QTL定位结果相结合，在我的定位区间内只有一个关联基因，如把两件事（GWAS与QTL）分开，我应该怎么… 显示全部 关注者 2
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